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Biologia molecular aplicada à diagnose de doenças de plantas. Infoteca-e
GONCALVES, R. C..
As doenças das plantas influenciam negativamente e de modo significativo as atividades agropecuárias e florestais em todo o mundo. Muitas epidemias tiveram como conseqüência grandes perdas econômicas, alterações sociais e ambientais.
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcadores genéticos.; Enfermedades y desórdenes de las plantas; Doença de planta; Marcador genético; Biologia Molecular.; Plant diseases and disorders; Molecular biology; Genetic markers..
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/661798
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Características morfológicas e moleculares e acúmulo de proteína em grãos de variedades de arroz do Maranhão PAB
Araújo,Elisangela Sousa de; Souza,Sonia Regina de; Fernandes,Manlio Silvestre.
O grão de arroz apresenta baixos teores de proteína, mas contém glutelina, uma proteína de melhor qualidade para a alimentação humana do que a de outros cereais. O objetivo deste trabalho foi caracterizar, por meio de descritores morfológicos e moleculares (RAPD), algumas variedades tradicionais de arroz do Estado do Maranhão que apresentam altos teores de proteínas nos grãos (mais de 10%) e são tolerantes ao estresse nutricional e ao Al tóxico. As 33 variedades estudadas foram separadas em cinco grupos baseados nas características morfológicas e quatro grupos utilizando marcadores RAPD, que não coincidiram entre si. Teores elevados de proteína no grão estavam presentes aleatoriamente em todos os grupos. No entanto, verificou-se maior acúmulo de proteína...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Oryza sativa; Marcador genético; Proteína bruta.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003001100005
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Caracterização de linhagens endogâmicas recombinantes e mapeamento de locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum PAB
Faleiro,Fábio Gelape; Schuster,Ivan; Ragagnin,Vilmar Antônio; Cruz,Cosme Damião; Corrêa,Ronan Xavier; Moreira,Maurílio Alves; Barros,Everaldo Gonçalves de.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar 154 linhagens endogâmicas recombinantes por meio da avaliação de características quantitativas, morfológicas, moleculares e de resistência a doenças e mapear locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 43 marcadores em nove grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 28 cM, com média de 7,3 cM. Os grupos de ligação variaram em tamanho de 2,3 a 61,2 cM. Os genes de resistência à ferrugem e à antracnose ficaram localizados no mesmo grupo de ligação. Foram mapeados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Mapa genético; Progênie; Marcador genético; Método de melhoramento.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003001200005
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Caracterização de rizóbios isolados de Jacatupé cultivado em solo salino no Estado de Pernanbuco, Brasil Bragantia
Freitas,Ana Dolores Santiago de; Vieira,Carolina Lucena; Santos,Carolina Etiene de Rosália e Silva; Stamford,Newton Pereira; Lyra,Maria do Carmo Catanho Pereira de.
Pesquisas sobre a biodiversidade microbiológica de solos salinos envolvem a busca por genótipos tolerantes a esse tipo de estresse ambiental. Dados genotípicos correlacionados às características morfológicas, fisiológicas e bioquímicas de bactérias fornecem informações importantes para sua identificação e agrupamento. Este trabalho objetivou caracterizar rizóbios provenientes de solos salinos, do Agreste e Sertão de Pernambuco, utilizando jacatupé (Pachyrhizus erosus L. Urban) como planta-isca. Os testes foram efetuados em meio YMA e as características culturais observadas em 24 isolados foram as seguintes: mudança de pH, tempo de crescimento, transparência, forma, borda, produção de exopolissacarídeo das colônias e resistência à salinidade. Os testes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fixação biológica do N2; Marcador genético; Características culturais e genéticas.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052007000300017
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Caracterização genética da raça bovina Crioulo Lageano por marcadores moleculares RAPD PAB
Spritze,Álvaro; Egito,Andréa Alves de; Mariante,Arthur da Silva; McManus,Concepta.
O objetivo deste trabalho foi a caracterização genética da raça bovina Crioulo Lageano por marcadores RAPD em comparação com as raças Holandesa e Nelore. Foram selecionados 43 primers, que geraram 77 bandas polimórficas. Os animais foram distribuídos em cinco subgrupos de Crioulo Lageano (I a V), e um subgrupo em cada uma das raças Holandesa (VI) e Nelore (VII). A maior parte da variância genética total (65,05%) foi causada pela diferença de indivíduos dentro dos grupos, e o restante pelas diferenças entre grupos. A análise conjunta dos grupos I a V apresentou variabilidade genética entre grupos de 25,28% e dentro dos grupos de 74,72%. A diversidade gênica vem se mantendo ao longo das gerações no núcleo de conservação do Crioulo Lageano. A raça Holandesa...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos taurus; Bos indicus; Bovino; Marcador genético; Variação genética.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003001000004
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Caracterização genética de isolados de macrofungos do gênero Agaricus, através de marcadores isoenzimáticos. Infoteca-e
HELM, C. V.; KESTRING, D. R.; CORADIN, J. H..
bitstream/item/65600/1/CT-292.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Macrofungo; Marcador genético; Fungo; Genética.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/931305
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Caracterização genética de ostras nativas do gênero Crassostrea no Brasil: base para o estabelecimento de um programa nacional de melhoramento. Infoteca-e
LEGAT, A. P.; OLIVEIRA, J. A. de; LAZOSKI, C. V. da S.; SOLE-CAVA, A. M.; MELO, C. M. R. de; GALVÉZ, A. O..
bitstream/item/80696/1/documento-192.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Ostreicultura; Marcador genético; Seleção genética; Linhagem; Aclimatação; Salinidade.
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/663864
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Caracterização genética de rizóbios nativos dos tabuleiros costeiros eficientes em culturas do guandu e caupi PAB
Fernandes,Marcelo Ferreira; Fernandes,Roberta Pereira Miranda; Hungria,Mariangela.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar geneticamente sete estirpes de rizóbios nativos dos tabuleiros costeiros de Sergipe com alta eficiência de fixação biológica do N2 em associação com guandu (Cajanus cajan) e caupi (Vigna unguiculata). A amplificação do DNA pela técnica de PCR (polymerase chain reaction) com o oligonucleotídeo específico BOX indicou um grau elevado de diversidade genética, uma vez que todas as estirpes apresentaram perfis únicos de DNA. A análise por BOX-PCR revelou, ainda, que essa metodologia é eficiente para diferenciar estirpes, mas não para a diferenciação de espécies de rizóbio. Pela técnica do RFLP (restriction fragment length polymorphism) da região do DNA que codifica o gene 16S rRNA e da região intergênica entre os genes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cajanus cajan; Vigna unguiculata; Biologia molecular; Fixação de nitrogênio; Marcador genético.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003000800003
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Desenvolvimento de marcador molecular para Bacillus subtilis utilizando proteomics. Infoteca-e
FIGUEIREDO, J. E. F.; COELHO, V. T. da S.; DE PAOLI, H. C.; BRESSAN, W.; PURCINO, A. A. C.; ROCHA, T. L.; PRATES, M. V..
bitstream/CNPMS/16148/1/Com_67.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcador genético.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/487513
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Determinação da pureza varietal de sementes de soja com o auxílio de marcadores moleculares microssatélites PAB
Schuster,Ivan; Queiroz,Vagner Tebaldi de; Teixeira,Arlindo Inês; Barros,Everaldo Gonçalves de; Moreira,Maurilio Alves.
Fatores ambientais contribuem para a produção de sementes de soja com características diferentes do padrão da variedade e a análise visual para determinação de pureza varietal não é suficiente. Marcadores moleculares de DNA podem auxiliar na identificação da pureza genética de sementes, durante o processo de certificação de sementes, uma vez que não sofrem influências ambientais. O objetivo deste trabalho foi avaliar um método de análise da pureza genética de sementes de soja, utilizando marcadores microssatélites. Amostras de DNA de sementes de soja, consideradas atípicas pelo método visual, foram analisadas com microssatélites e comparadas ao padrão da variedade. As amostras de DNA foram analisadas em bulk, o que permitiu diminuir os custos, com a mesma...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Cultivar; Marcador genético; Método de melhoramento.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2004000300007
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Mapeamento de QTL em famílias de irmãos completos por meio de modelos aleatórios Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Silva,M.V.G.B; Martinez,M.L.; Torres,R.A.; Lopes,P.S.; Euclydes,R.F.; Machado,M.A.; Arbex,W..
Foi realizado um estudo por meio de simulação para avaliar a eficiência e o poder dos modelos aleatórios na estimação da localização e dos componentes de variância relativos a dois QTLs presentes no mesmo cromossomo, posicionados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes ou não. Admitiram-se diferentes tamanhos e números de famílias de irmãos completos e variâncias dos QTLs, em característica com herdabilidade igual a 0,25. A estimação dos parâmetros foi obtida por meio do método da máxima verossimilhança, baseado no quadrado da diferença de pares de irmãos, sob mapeamento por intervalo. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir da proporção IBD de dois marcadores flanqueadores. Os fatores que mais...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352004000200014
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Melhoramento molecular da tolerância ao alumínio em sorgo. Infoteca-e
MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, C. T.; SCHAFFERT, R. E..
A toxidez causada pelo alumínio (Al) danifica o sistema radicular, restringindo a absorção de água e de nutrientes, resultando em perdas de produção por culturas cultivadas em solos ácidos. A toxidez de Al restringe o aprofundamento do sistema radicular, potencializando ainda os efeitos deletérios do estresse causado pela deficiência hídrica na produção vegetal. Em sorgo, a tolerância ao Al é conferida em grande parte pelo loco AltSB, mapeado na porção terminal do cromossomo 3. O gene que condiciona o loco AltSB, denominado SbMATE, é um transportador de citrato induzido e ativado pelo Al, que detoxifica o Al pela exclusão do metal de sítios sensíveis nos ápices radiculares. Vários marcadores moleculares foram desenvolvidos para o loco AltSB para permitir o...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Tolerância ao alumínio; SbMATE; Seleção assistida; Sorghum bicolor; Marcador genético; Genética molecular; Genetic markers; Molecular genetics.
Ano: 2013 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/982968
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Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos R. Bras. Zootec.
Silva,Marcos Vinicius G. Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Pereira,Carmen Silva; Machado,Marco Antônio; Arbex,Wagner.
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h² = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000100009
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Obtenção de híbridos somáticos de limão 'Cravo' e tangerina 'Cleópatra' PAB
Latado,Rodrigo Rocha; Derbyshire,Maria Teresa Vitral de Carvalho; Tsai,Siu Mui; Tulmann Neto,Augusto.
Este trabalho teve como objetivo a obtenção de híbridos somáticos entre o limão 'Cravo' (Citrus limonia Osbeck) e a tangerina 'Cleópatra' (Citrus reshni Hort.), para serem usados como porta-enxertos de citros. O limão 'Cravo' é atualmente o principal porta-enxerto comercial utilizado no Brasil, em virtude de suas boas qualidades agronômicas. Entretanto, é suscetível ao "declínio" dos citros, doença responsável pela eliminação anual de milhões de plantas cítricas no Brasil. A tangerina 'Cleópatra' é uma espécie bastante utilizada como porta-enxerto em outros países e tem sido descrita na literatura como tolerante ao "declínio". Protoplastos de suspensões celulares embriogênicas e protoplastos derivados de tecidos foliares foram utilizados para fusão com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Protoplastos; Marcador genético; Polimorfismo genético; Porta-enxerto; Citros.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2002001200009
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Otimização dos microssatélites BM4311, BMC1207, BMS1004, BMS1617, BMS6026 e CSKB074 em multiplexes. Infoteca-e
BENAVIDES, M. V..
Processo de otimização; Descrição sucinta da técnica; Caracterização; Impactos esperados.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Microssatélite; Marcador genético.
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/662925
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Teste de marcadores bioquímicos na identificação de prováveis indivíduos homozigotos dominantes para o gene tobiano em cavalos Pampa Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Coelho,E.G.A.C.; Oliveira,D.A.A.; Cothran,E.G.; Teixeira,C.S.; Nunes,R.L..
Utilizaram-se 195 cavalos Pampa e um grupo-controle de 41 cavalos da raça Paint, provenientes de plantéis de várias regiões brasileiras, com o objetivo de avaliar a eficiência do teste mediante uso de marcadores bioquímicos: albumina (Al) e proteína de ligação da vitamina D (Gc), para identificação dos possíveis indivíduos homozigotos dominantes para o padrão de pelagem tobiano nos cavalos Pampa. Não foram encontrados genótipos AlBB e GcSS, revelando indício de quebra de ligação gênica entre tais locos e o loco tobiano e a ineficácia do teste bioquímico na detecção dos prováveis indivíduos homozigotos dominantes para o padrão de pelagem tobiano nos cavalos Pampa.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cavalo Pampa; Cavalo Paint; Tobiano; Marcador genético; Albumina; Proteína de ligação da vitamina D (Gc).
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352007000400027
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Um estudo comparativo de softwares para alinhamento e detecção de Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Infoteca-e
NARCISO, M. G.; RODRIGUES, A. M.; CIESLAK J. F.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Introdução. Materiais e Métodos. Resultados e Discussão. BWA e SAMtools. Bowtie2 e SAMtools. Panati. Mosaik. VarScan. GATK. CLC Genomics. Tempo de execução do software. Resumo sobre cada software. Conclusões. Referências.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Software; Alinhamento de sequencia; Detecção de SNPs; Marcador molecular; Polimorfismo genético; Marcador genético.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/990798
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